O interesse na igreja de Saunière gerado pelas histórias inspirou duas escavações realizadas na igreja de santa Maria Madalena . A primeira foi organizada pelo Dr. André Malacan, em Maio de 1956, que, depois de escavar o subsolo da igreja a uma profundidade de cerca de um metro, descobriu alguns ossos que incluíam um crânio contendo uma incisão. Porém, eles não conseguiram descobrir qualquer coisa de real interesse17 . Dr. Malacan morreu em 1997 e o crânio está atualmente em posse de sua família. Entre os anos de 1959 e 1963, Jacques Cholet, um engenheiro de Paris, também realizou várias escavações na igreja e também não conseguiu descobrir qualquer coisa relevante18 .
Em novembro de 1956, Monsieur Cotte, iniciou uma investigação sobre o assunto, que se estendeu até Março de 1957. O historiador local, René Descadeillas, comentou: "Eles não encontraram nenhuma evidência de qualquer lugar para apoiar a afirmação de que , ao longo dos séculos , qualquer indivíduo , família, grupo ou clã poderia ter acumulado um precioso tesouro de Rennes e depois escondeu na localidade ou seus arredores . Além disso, as atividades do Abbé Saunière foram, sem dúvida eloquente do tipo de estratagemas que ele estava acostumado a usar , a fim de enriquecer a si mesmo"19 .